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業務職掌工作內容
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分機
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- 常規預防接種、疫苗及 NIIS 系統管理
- 流感預防接種
- 急性病毒性肝炎防治
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分機：526
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- 防疫業務綜合管理
- 經費管理
- 實驗室生物安全
- 旅遊暨不明原因傳染病
- 其他人畜共通傳染病（傳染途徑不明）、肉毒、庫賈、鉤端、弓形、毒蛇血清
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分機：374
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- 腸病毒防治
- 腸道及水患傳染病防治
- 集體腸胃道症狀
- 防疫物資管理
- 學校監測及預警系統
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分機：316
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- 愛滋病及性病防治（毒防）
- 醫院感染管制業務
- 先期計畫-重大傳染病、綜發計畫- 營業衛生
- 配合兒少、婦幼等性平議題
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分機：318
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- 營業衛生管理
- 人口密集機構感染管制
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分機：319
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- 辦理蟲媒傳染病防治（含頭蝨）
- 辦理三麻一風防治
- 協辦人口密集機構感染管制
- 協辦腸道及水患傳染病防治
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分機：314
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- 傳染病防治醫療網演/訓練
- 生物病原災害防治、災害防救、全民防衛動員
- 呼吸道傳染病
- 入境檢疫管理
- 協辦防疫物資管理
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分機：312
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- 檢體運送
- 協辦預防接種及疫苗管理
- 協辦 NIIS 系統管理
- 協辦急性病毒性肝炎防治
- 生命統計(中興新村)
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分機：311
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- 辦理外勞衛生管理
- 辦理公文系統管理
- 協辦檢體運送
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分機：317
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- 研考
- 協辦愛滋病及性病防治
- 愛滋病個案管理
- 協辦兒少、婦幼等性平議題、傳染病監測及疫調系統管理、傳染病帳號維護
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分機：343
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- 總務（環境、財產及宣導品管理）
- 協辦預防接種及疫苗管理
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分機：341
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